6 декабря 1920 года приказом № 102 Народного комиссара здравоохранения России H.A. Семашко Евпаторийско — Сакская военно-санитарная курортная станция была включена в состав военно-санитарных учреждений Красной Армии.

Евпаторийский Центральный детский клинический санаторий Министерства обороны Украины отметил своё 90 летний юбилей. Сегодня санаторий — это многопрофильная образцовая детская клиническая здравница для лечения больных с детской патологией центральной и периферической нервной системы, опорно-двигательного аппарата и респираторными аллергозами. За прошедшие 90 лет в санатории Министерства обороны Украины пролечились и отдохнули 235 тысяч детей, из них примерно 197 тысяч — инвалиды с детства.

Начальник санатория – врач ортопед-травматолог высшей категории, кандидат медицинских наук, Заслуженный врач Украины и Автономной Республики Крым, полковник медицинской службы в отставке НЕНЬКО Анатолий Михайлович.

19 марта 2003 года Анатолий Михайлович Ненько (1934 г) Руководитель Евпаторийского центрального детского клинического санатория Министерства Обороны, кандидат медицинских наук, заслуженный врач Украины и АРК, лауреат Государственной премии Украины и премии С. Э. Дувана, действительный член медико-технической Академии РФ, кавалер ордена «За заслуги» II степени, детский ортопед-травматолог высшей категории удостоен звания «Почётный гражданин» Евпатории за создание материально- технической и медицинской базы детского клинического санатория, усовершенствование качества обследования и санаторно-курортного лечения больных детей- инвалидов, организацию и проведение научно- практических исследований, а также за многолетнюю активную деятельность на благо жителей города.

За всю историю санатория его предназначение изменялось в зависимости от социальных программ государства, актуальности и приоритета той или иной детской патологии: костно-суставной туберкулез (1920-1950 годы); малярия (1930-1940 годы); последствия полиомиелита (1950-1980 годы); детский церебральный паралич, родовой паралич руки, последствия нейроинфекции, последствия хирургического лечения спинномозговых грыж, сколиотическая болезнь, врожденный вывих бедра и его последствия, остеохондропатии различной локализации.

С 60-х годов – специализацией санатория становятся ревматические заболевания сердца (1960-1980 годы); респираторные аллергозы — с 1990 года; реабилитация детей из зон с неблагополучным радиоактивным фоном и антропогенным загрязнением местности — с 1986 года.

В соответствии с этими приоритетам планировалось и проводилось комплексное санаторно-курортное восстановительное лечение, медицинская и социальная реабилитация, а также научно-практическая работа.

В санатории широко применяются передовые методы лечения детской патологии, используются компрессионно-дистракционные аппараты внешней фиксации, различных (запатентованных) хирургических операций — сухожильно-мышечная пластика, перемещение мышц и мышечно-сосудистых комплексов; применение лавсановых лент; костнопластическая резекция и костно-пластический артродез у детей с полиомиелитом, акушерским параличом, детским церебральным параличом; хирургическое лечение врожденного вывиха бедра и его последствий, хирургическое лечение болезни Пертеса и дистрофии головки бедренной кости после вправления врожденного вывиха бедра, хирургическое лечение системных врожденных и приобретенных деформаций конечностей, хирургическое лечение ювенильного ревматоидного артрита, хирургическое лечение сколиотической болезни и туберкулезного спондилита у детей, ортезирование.

В здравнице проводят грязе- и водолечение, респираторную и лазерную терапии, физиотерапию, иглорефлексотерапию, психотерапию, лечебную физкультуру и даже иппотерапию.

В перспективных  планах санатория Министерства Обороны оснащение операционно-перевязочного блока необходимым специальным оборудованием для проведения хирургического лечения сколиозов, эндопротезирования крупных суставов, лечебной и диагностической артроскопии крупных суставов, миофибротомии по методу Ульзибата; организовать на базе санатория коррекционный центр с дисграфическими нарушениями; открыть специализированную поликлинику амбулаторного наблюдения и лечения детей Украины и Крыма; подготовить базу и организовать отделение психокоррекции для семейного лечения и отдыха семей.

На территории санатория Министерства обороны есть собственная скважина термальной минеральной йодо-бромной хлоридно-натриевой с примесью сероводорода воды, которая также используется в лечении.

Для диагностики заболеваний работают оснащенные современной аппаратурой лаборатории нейро-функциональных исследований, биомеханики, исследований сердечно-сосудистой системы и функции внешнего дыхания, рентгенологический и эндоскопический кабинеты. В санатории консультируют специалисты различного профиля, в том числе отоларинголог, стоматолог, гинеколог и уролог. При необходимости проводятся хирургические операции с последующей реабилитацией.