В 1941 году 20 июня – накануне вероломного вторжения фашистов на территорию СССР – в Артеке проходил заезд новой смены. В воскресенье, 22 июня в лагере ждали почётных гостей из Гурзуфского военного санатория, но они – командиры Красной Армии – не приехали. Когда ребята завтракали, по радио прозвучало сообщение, что на нашу страну напала фашистская Германия.
С первых дней войны ребят, прибывших в лагерь Артек на отдых, стали отправлять по домам небольшими группами. Однако около 200 человек по-прежнему оставались в стенах лагеря. Это были ребята из Молдавии, Белоруссии, Прибалтики, Западной Украины, на родной земле которых уже шли ожесточенные бои.
Решением Наркомздрав и ЦК ВЛКСМ СССР из этих детей сформировали специальную группу и отправили в Белокуриху по маршруту: Симферополь – Москва – Горький – Казань – Сталинград – ст. Нижнее-Чирская – Сталинград – Фролово («Серебряные пруды») – Камышин – Казань – Уфа – Омск – Новосибирск – Барнаул – Бийск – Белокуриха – Артек. Общий путь составил 7750 км. В дороге на Алтай ребята провели 16 месяцев.
С 11 сентября 1942 года Артек находился на Алтае, отчего получил название Алтайский «Артек». Лагерь вплоть до 12 января 1945 года принял около 500 ребят из городов и поселений Сибири. Неизменно в Артеке находились и те 200 человек, которые прожили в лагере самое продолжительное время – 4 года. За это время им удалось заработать 116 000 рублей, на которые они купили танк Т-34 и подарили его танкистам. За это Верховный главнокомандующий поблагодарил пионеров правительственной телеграммой.
За всё время пребывания в лагере ученики и вожатые сильно сдружились. Эта дружба преодолела множество препятствий, её пронесли сквозь годы и сохранили до сегодняшнего дня. Несмотря на то, что артековцы после окончания войны разъехались по своим домам в разные уголки нашей страны, они по-прежнему поддерживают связь со своими товарищами. В стенах Артека постоянно организовываются встречи, на которых уже седые пионеры тех лет приезжают со своими детьми, внуками, правнуками…
Сводный отряд пионеров военных лет жил по девизу:
«Артек» – наше детство,
«Артек» – наша юность,
«Артек» – наша зрелость,
«Артек» – в нас навсегда!»
В ноябре 1941 года немецко-румынские захватчики вошли на территорию лагеря. Они не оставили камня на камне: пристань лагеря «Суук-Су» и «Нижнего» лагеря были полностью разрушены. Оставшиеся в Артеке работники погибли смертью храбрых, защищая свой любимый Артек.