В 1805 году греческая община построила в Евпатории православный Свято-Николаевский собор, позже, в 1896-1898 году, на его месте был возведён русский православный собор Святого Николая. Со временем греческое население Евпатории увеличилось настолько, что прихожане уже не могли поместиться в одном православном соборе, к тому же греки плохо понимали богослужения, которые велось на русском языке.

В 1901 году по просьбе греческой общины городская Дума выделила участок земли (600 кв. метров) на берегу моря под строительство греческого храма, с условием интенсивной застройки.

Греческая община Евпатории была не богатой и нуждалась в субсидиях. В 1908 году глава греческой общины Василькиоти Ф.И обратился в городскую Думу с просьбой выделить 5000 рублей для строительства храма.

Городской голова Евпатории Семён Эзрович Дуван (1906 — 1910 г.г.) распорядился ежегодно в течении пяти лет выдавать греческой общине 1000 рублей, за такую помощь греческий король наградил его крестом Святого Спасителя.

Строительные работы греческого храма в Евпатории начались только 6 июня 1911 года. Храм Святого пророка Ильи строился по проекту евпаторийского архитектора Адама Генриха.

В 1917 году евпаторийский мещанин Николаиди  выдал кредит греческой общине 25 тысяч рублей, с условием ежегодного погашения долга, который так и не был погашен.

Художник Иван Кудрявцев. Храм Святого пророка Ильи

30 июня 1918 года храм Святого Ильи Пророка был освящён и принял православных греческих прихожан греко-православной  общины Евпатории,   богослужение в храме проходило на русском и греческом языках.

Храм построен в греко-византийском стиле из ракушечника, украшен декоративными украшениями в виде зубцов. Крестово-купольная постройка строго ориентирована по сторонам света и украшена тройными окнами с цветными витражами.

 Арочный центральный вход храма, опирается на две полуколонны и возвышается над полукруглой многоступенчатой папертью.

В Свято-Ильинском храме Евпатории служил новомученик Елизарий, пострадавший за веру в советский период, известный учёный — византиевед, специалист по истории Византии — занимался изучением её культуры, религии, права, церковных институтов. Его научные труды внесли вклад в византиноведение как область исторической науки.

В годы советской власти греческий храм Святого пророка Ильи был закрыт, а договор с греческой общиной расторгнут 9 февраля 1932 года.

Трёхъярусная звонница храма была разрушена в 1959 году, колокол снят и даже предпринимались попытки сноса храма, но строение оказалось очень прочным. Храм долгое время  использовался для размещения различных советских учреждений. Здесь были и склады, и спортивный зал боксёрской секции, и борцовский клуб.

В 2003 году храм Святого пророка Ильи был отреставрирован, восстановлено его внутренне убранство, интерьер и фрески, выполненные в новогреческом стиле. Церковь передана верующим, в ней проводятся ежедневные богослужения. 

Заново построена звонница храма, освящены и установлены колокола, изготовленные в г. Днепропетровске спец-предприятием «Благовест». Поверхности большого церковного колокола  (диаметр 84 см., высота -89см.) украшена надписью:

«Сей колокол отлит в честь 2500-летия богоспасаемого града Евпатории в лето 2003 от Рождества Христова для храма пророка Илии».

В церкви Святого Ильи Пророка находится лампада с живым священным огнём, доставленная из храма греческого города-побратима Закинтос.

В преддверии праздника Воздвижения Честнаго Животворящего Креста Господня, 26 сентября 2012 года был освящён и установлен новый крест на куполе храма Святого Пророка Ильи в Евпатории.

 Настоятель храма отец Георгий Куницын назвал установку нового креста событием историческим, имеющим большое духовное значение. Новый крест Свято-Ильинского храма был изготовлен севастопольскими мастерами из прочного сплава металлов, из нержавеющей стали.

Храм Святого Пророка Илии является украшением береговой линии города и дополняет архитектурный облик Евпатории со стороны моря, а также памятником архитектуры государственного значения и находится под охраной государства.

Свято-Ильинский храм расположен на набережной имени Терешковой, рядом с морским портом и причалом яхт-клуба. 

Адрес Храма Святого пророка Ильи — ул. Братьев Буслаевых, 5. городской тел. 3-35-13.

Греческая община «Элефтерия« находится по адресу Евпатория, ул. Сытникова, 10, городской тел. 3-00-42.

Православные храмы Евпатории:

Свято-Николаевский собор.
Храм Святителя Луки в Евпатории.
Армянская церковь Сурб-Никогайос (Св. Николая)